Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NFIXQ14938 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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NFIXQ14938 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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NFIXQ14938 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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NFIXQ14938 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NFIXQ14938 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
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NFIXQ14938 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NFIXQ14938 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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NFIXQ14938 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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NFIXQ14938 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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NFIXQ14938 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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NFIXQ14938 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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NFIXQ14938 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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