Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FHL3Q13643 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FHL3Q13643 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms