Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PEX6Q13608 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PEX6Q13608 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms