Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEUROD1Q13562 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEUROD1Q13562 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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