Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TUSC3Q13454 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUSC3Q13454 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUSC3Q13454 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUSC3Q13454 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUSC3Q13454 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUSC3Q13454 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TUSC3Q13454 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUSC3Q13454 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TUSC3Q13454 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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