Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TCOF1Q13428 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.76□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TCOF1Q13428 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.8□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.83□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TCOF1Q13428 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
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