Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SP140Q13342 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SP140Q13342 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SP140Q13342 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SP140Q13342 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SP140Q13342 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SP140Q13342 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SP140Q13342 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SP140Q13342 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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SP140Q13342 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SP140Q13342 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SP140Q13342 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SP140Q13342 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SP140Q13342 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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SP140Q13342 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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SP140Q13342 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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SP140Q13342 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SP140Q13342 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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SP140Q13342 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SP140Q13342 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SP140Q13342 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SP140Q13342 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SP140Q13342 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SP140Q13342 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SP140Q13342 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SP140Q13342 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SP140Q13342 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SP140Q13342 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SP140Q13342 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SP140Q13342 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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