Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BNIP3Q12983 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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BNIP3Q12983 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BNIP3Q12983 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP3Q12983 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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