Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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HOXC5Q00444 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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HOXC5Q00444 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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HOXC5Q00444 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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HOXC5Q00444 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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HOXC5Q00444 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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HOXC5Q00444 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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HOXC5Q00444 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HOXC5Q00444 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXC5Q00444 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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