Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRBP23467 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
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