Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXA3O43365 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXA3O43365 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXA3O43365 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA3O43365 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA3O43365 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXA3O43365 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXA3O43365 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXA3O43365 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXA3O43365 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXA3O43365 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXA3O43365 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXA3O43365 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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