Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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