Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184 ms