Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBM42Q9BTD8 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM42Q9BTD8 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM42Q9BTD8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBM42Q9BTD8 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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