Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ANKRD39Q53RE8 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ANKRD39Q53RE8 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ANKRD39Q53RE8 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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