Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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CCDC6Q16204 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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CCDC6Q16204 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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CCDC6Q16204 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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CCDC6Q16204 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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CCDC6Q16204 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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CCDC6Q16204 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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CCDC6Q16204 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC6Q16204 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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