Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
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SHPRHQ149N8 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SHPRHQ149N8 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-3.42□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
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