Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RBM39Q14498 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RBM39Q14498 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RBM39Q14498 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275 ms