Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCINQ13939 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCINQ13939 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCINQ13939 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCINQ13939 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCINQ13939 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCINQ13939 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCINQ13939 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCINQ13939 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCINQ13939 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCINQ13939 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCINQ13939 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCINQ13939 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCINQ13939 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCINQ13939 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCINQ13939 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCINQ13939 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCINQ13939 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCINQ13939 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCINQ13939 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCINQ13939 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCINQ13939 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CCINQ13939 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCINQ13939 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCINQ13939 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCINQ13939 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCINQ13939 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCINQ13939 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCINQ13939 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCINQ13939 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCINQ13939 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCINQ13939 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCINQ13939 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCINQ13939 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CCINQ13939 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CCINQ13939 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCINQ13939 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CCINQ13939 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCINQ13939 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCINQ13939 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCINQ13939 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCINQ13939 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCINQ13939 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCINQ13939 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCINQ13939 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCINQ13939 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCINQ13939 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCINQ13939 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCINQ13939 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCINQ13939 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCINQ13939 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCINQ13939 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCINQ13939 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCINQ13939 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCINQ13939 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCINQ13939 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCINQ13939 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCINQ13939 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCINQ13939 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCINQ13939 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCINQ13939 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCINQ13939 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CCINQ13939 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CCINQ13939 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCINQ13939 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCINQ13939 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCINQ13939 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCINQ13939 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCINQ13939 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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