Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
IRF5Q13568 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IRF5Q13568 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IRF5Q13568 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IRF5Q13568 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.1 ms