Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TUBB3Q13509 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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TUBB3Q13509 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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TUBB3Q13509 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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TUBB3Q13509 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TUBB3Q13509 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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