Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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TCIRG1Q13488 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TCIRG1Q13488 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TCIRG1Q13488 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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TCIRG1Q13488 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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TCIRG1Q13488 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCIRG1Q13488 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCIRG1Q13488 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCIRG1Q13488 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCIRG1Q13488 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCIRG1Q13488 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TCIRG1Q13488 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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