Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ERCC8Q13216 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ERCC8Q13216 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ERCC8Q13216 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.3 ms