Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MRPL28Q13084 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
MRPL28Q13084 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.12□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MRPL28Q13084 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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