Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRJQ12913 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRJQ12913 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRJQ12913 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms