Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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HOXC5Q00444 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXC5Q00444 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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HOXC5Q00444 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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HOXC5Q00444 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXC5Q00444 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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HOXC5Q00444 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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HOXC5Q00444 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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HOXC5Q00444 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
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HOXC5Q00444 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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HOXC5Q00444 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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HOXC5Q00444 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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HOXC5Q00444 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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HOXC5Q00444 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXC5Q00444 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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