Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRXP46100 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRXP46100 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRXP46100 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRXP46100 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRXP46100 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRXP46100 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRXP46100 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRXP46100 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRXP46100 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRXP46100 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRXP46100 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRXP46100 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRXP46100 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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