Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRMP28827 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRMP28827 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 366.3 ms