Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPRDP23468 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
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