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Protein–RNA interactions for Protein: O15551
CLDN3, Claudin-3, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CLDN3
O15551
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□□□□□ -2.57
CLDN3
O15551
Y_RNA.568-201
ENST00000384742
113 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
CLDN3
O15551
RNU6-86P-201
ENST00000606534
107 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
CLDN3
O15551
RNU6-973P-201
ENST00000364690
107 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
CLDN3
O15551
Y_RNA.353-201
ENST00000365440
108 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
CLDN3
O15551
SNORD116-18-201
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92 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
CLDN3
O15551
RNU6-75P-201
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104 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
CLDN3
O15551
SCARNA15.1-201
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125 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
CLDN3
O15551
U7.2-201
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63 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
CLDN3
O15551
Y_RNA.377-201
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108 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
RNU6-394P-201
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107 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
MIR4324-201
ENST00000584846
72 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
MIR6738-201
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64 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
Y_RNA.29-201
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113 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
AC025166.1-201
ENST00000612411
163 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
DLEU2_3.1-201
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73 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
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BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
Y_RNA.163-201
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113 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
Y_RNA.220-201
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109 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
RNU6-463P-201
ENST00000384340
107 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
RNU6-476P-201
ENST00000384726
107 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
MIR518B-201
ENST00000385127
83 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
SNORD42B-201
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67 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
AC097510.1-201
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133 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
RNU6-65P-201
ENST00000516332
98 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
MIR4536-1-201
ENST00000583537
88 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
ZNRD1-AS1_1.6-201
ENST00000610339
68 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
AC025521.1-201
ENST00000621624
286 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
MTND5P18-201
ENST00000445624
1801 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
RNU6-1052P-201
ENST00000411398
104 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
AC008883.1-201
ENST00000506562
193 nt
TSL 3
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
RNU6-719P-201
ENST00000516671
104 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
RNU6-10P-201
ENST00000384036
107 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
MIR587-201
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96 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
MIR577-201
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96 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
AC004792.1-201
ENST00000614523
137 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
MIRLET7F1-201
ENST00000362202
87 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
CLDN3
O15551
RNU6-379P-201
ENST00000363813
104 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
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O15551
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BASIC
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O15551
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O15551
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□□□□□ -2.58
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O15551
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O15551
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BASIC
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O15551
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O15551
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O15551
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227 nt
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□□□□□ -2.59
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O15551
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O15551
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O15551
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O15551
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TSL 2
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
CLDN3
O15551
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O15551
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BASIC
-1.1
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CLDN3
O15551
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BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
CLDN3
O15551
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BASIC
-1.11
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CLDN3
O15551
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BASIC
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O15551
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O15551
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O15551
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O15551
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O15551
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BASIC
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O15551
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BASIC
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O15551
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BASIC
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O15551
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BASIC
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O15551
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BASIC
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O15551
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O15551
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O15551
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BASIC
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CLDN3
O15551
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BASIC
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CLDN3
O15551
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O15551
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O15551
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□□□□□ -2.59
CLDN3
O15551
Y_RNA.583-201
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BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CLDN3
O15551
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BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CLDN3
O15551
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109 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CLDN3
O15551
MIR3165-201
ENST00000579874
75 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CLDN3
O15551
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ENST00000612812
74 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CLDN3
O15551
snoR1.1-201
ENST00000628177
80 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CLDN3
O15551
SNORA63.2-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
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102 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
RNU4-36P-201
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144 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
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120 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
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107 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
MIR378F-201
ENST00000578143
78 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
MIR4679-2-201
ENST00000578358
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BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
MIR8068-201
ENST00000618032
68 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
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BASIC
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□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
RNU6-132P-201
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107 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
Y_RNA.514-201
ENST00000384528
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BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
IL6ST-207
ENST00000396816
168 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
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ENST00000516095
111 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
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99 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
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ENST00000583746
80 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CLDN3
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BASIC
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81 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
CLDN3
O15551
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108 nt
BASIC
-1.18
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CLDN3
O15551
AC022137.1-201
ENST00000483735
151 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
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