Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MEIS1O00470 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
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MEIS1O00470 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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MEIS1O00470 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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MEIS1O00470 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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MEIS1O00470 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MEIS1O00470 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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MEIS1O00470 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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