Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP17L12C9JPN9 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP17L12C9JPN9 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP17L12C9JPN9 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USP17L12C9JPN9 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP17L12C9JPN9 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP17L12C9JPN9 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP17L12C9JPN9 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP17L12C9JPN9 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP17L12C9JPN9 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USP17L12C9JPN9 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.3 ms