Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SOBPA7XYQ1 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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