Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VGLL1Q99990 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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