Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PITX2Q99697 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PITX2Q99697 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PITX2Q99697 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms