Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.2 ms