Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNRNP35Q16560 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNRNP35Q16560 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms