Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TNXAQ16473 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TNXAQ16473 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TNXAQ16473 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms