Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SIX1Q15475 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SIX1Q15475 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SIX1Q15475 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172 ms