Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PCOLCEQ15113 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PCOLCEQ15113 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PCOLCEQ15113 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms