Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FHL3Q13643 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FHL3Q13643 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FHL3Q13643 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.7 ms