Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IRF5Q13568 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF5Q13568 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IRF5Q13568 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.8 ms