Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMAD4Q13485 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMAD4Q13485 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMAD4Q13485 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
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