Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP140Q13342 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP140Q13342 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP140Q13342 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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SP140Q13342 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP140Q13342 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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SP140Q13342 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP140Q13342 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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SP140Q13342 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP140Q13342 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP140Q13342 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SP140Q13342 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SP140Q13342 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SP140Q13342 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SP140Q13342 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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SP140Q13342 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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SP140Q13342 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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SP140Q13342 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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SP140Q13342 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
SP140Q13342 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
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