Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CLN3Q13286 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CLN3Q13286 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
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