Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
IFT88Q13099 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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IFT88Q13099 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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IFT88Q13099 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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IFT88Q13099 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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IFT88Q13099 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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IFT88Q13099 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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IFT88Q13099 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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IFT88Q13099 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
IFT88Q13099 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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