Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPN13Q12923 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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