Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMA1Q12791 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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KCNMA1Q12791 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMA1Q12791 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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