Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PIK3CBP42338 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PIK3CBP42338 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PIK3CBP42338 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms