Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGAEP38570 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGAEP38570 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ITGAEP38570 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms