Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXD10P28358 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXD10P28358 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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